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1、如果因偷税、骗税被处罚，会有影响，税务机关会取消高新技术企业资格。
2、之前公司因执业情况受到税务部门行政处罚过一次，后来解决了，可以申报高新技术企业。
3、有严重环境违法行为的，会被取消高新技术企业资格 例如：2018 年 6 月-11 月，因发生严重环境违法和环保行政处罚，江苏省的汇鸿（南通）安全用品有限公司、浙江省的海盐哈特惠机械五金制品有限公司和临安华龙摩擦材料有限公司被取消高新技术企业资格。
4、税务行政处罚对企业的影响如下：违反税务管理基本规定行为的处罚可以处2000元以下的罚款；情节严重的，处2000元以上1万元以下的罚款。处2000元以上1万元以下的罚款；情节严重的，处1万元以上5万元以下的罚款。如果因偷税、骗税被处罚，会有影响，税务机关会取消高新技术企业资格。
5、符合认定条件的，高企资格不变；如果不符合认定条件，高企资格会在自条件变化年度起取消，所属年度起已享受的高企税收优惠将被税务机关追缴。高新技术企业认定并非终身制，高企资格的有效期为三年，到期需要重新认定，企业管理人员要提前做好知识产权、成果转化等各项工作的安排，才能顺利重新认定。
